Comme avec beaucoup de problèmes complexes du référencement, il n’y a pas qu’une seule réponse possible. Il est souvent intéressant de faire un compromis dans la structure d’un site entre une structure profonde et une structure plate.

La structure profonde permet de créer des pages hiérarchisées dans la structure globale du site.
Au contraire, une structure plate permet de réduire la profondeur des niveaux que certains référenceurs considèrent comme pénalisante pour l’indexation des pages notamment.
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L’inconvénient d’une structure plate, c’est qu’elle permet difficilement de mettre en avant certaines pages parmi l’ensemble des pages d’un site. En effet, avec un menu linéaire, toutes les pages sont reliées entre elles de façon équilibrée. Il en résulte ainsi une distribution linéaire du Pagerank interne du site et la page des informations légales se retrouve au même niveau d’importance que votre page d’accueil.
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L’avantage de la structure profonde hiérarchisée (voir le schéma exemple d’une structure en silo), c’est qu’elle permet simplement et efficacement de définir des têtes de gondoles et ainsi, par un maillage interne intelligent, de concentrer le Pagerank sur les pages principales du site et de ne laisse que des miettes aux pages de contact, CGV et autres du même genre.

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Alors qu’elle est la bonne attitude à adopter. Faut-il faciliter l’indexation, donc, la prise en compte du contenu du site ou alors mettre en avant certaines pages au risque que d’autres pages de contenu soient peu ou prou indexées ? La réponse doit se trouver en chaque site et le compromis semble donc nécessaire.